Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2e3P52483 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms