Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e1P52482 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ube2e1P52482 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms