Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pold1P52431 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Pold1P52431 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pold1P52431 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms