Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms