Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms