Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms