Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms