Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl28P41105 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms