Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TfamP40630 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TfamP40630 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TfamP40630 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TfamP40630 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms