Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ThpoP40226 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms