Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk2P38575 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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