Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppm1bP36993 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms