Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RetP35546 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RetP35546 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RetP35546 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RetP35546 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RetP35546 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RetP35546 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RetP35546 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RetP35546 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RetP35546 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms