Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab23P35288 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms