Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc5P32043 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms