Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd1P30999 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms