Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms