Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms