Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms