Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfraP26618 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms