Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk11bP24788 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms