Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edn1P22387 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Edn1P22387 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms