Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms