Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ntf3P20181 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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