Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VimP20152 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VimP20152 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VimP20152 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VimP20152 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VimP20152 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VimP20152 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VimP20152 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms