Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms