Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18529 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P18529 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P18529 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P18529 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P18529 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18529 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18529 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18529 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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