Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou4f1P17208 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou4f1P17208 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms