Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tgfb3P17125 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms