Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmga1P17095 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms