Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim30aP15533 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms