Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms