Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TtrP07309 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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