Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt1P04104 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms