Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms