Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01822 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01822 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01822 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P01822 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01822 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01822 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms