Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01656 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01656 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01656 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01656 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01656 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01656 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01656 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01656 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms