Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01654 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01654 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01654 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01654 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01654 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01654 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01654 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01654 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01654 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms