Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igk-V19-17P01633 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms