Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AurkcO88445 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AurkcO88445 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms