Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaskO70589 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaskO70589 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaskO70589 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaskO70589 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaskO70589 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms