Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx2O70340 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms