Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlx3O55144 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms