Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdkO55028 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BckdkO55028 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BckdkO55028 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BckdkO55028 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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