Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pole2O54956 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms