Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2f6O54917 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2f6O54917 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms