Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk2O54781 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk2O54781 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk2O54781 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk2O54781 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk2O54781 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk2O54781 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srpk2O54781 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms