Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn6O35646 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms