Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rabep1O35551 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabep1O35551 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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