Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccrl2O35457 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms